Stanowisko: Stypendysta-Doktorant
Poszukujemy osoby do pracy na stanowisku Stypendysta - DOKTORANT w Zakładzie Chemii Produktów Pochodzenia Naturalnego. Oferowane stypendium w ramach projektu badawczego pt.: „Rola produktów naturalnych w przezwyciężaniu lekooporności Mycobacterium tuberculosis” finansowane jest ze środków przyznanych przez Narodowe Centrum Nauki.
Kierownikiem projektu jest dr hab. Elwira Sieniawska
Planowany czas realizacji zadań w projekcie wynosi 24 miesiące z możliwością przedłużenia do 36 miesięcy.
Streszczenie projektu
Celem projektu jest określenie synergistycznego mechanizmu działania antybiotyków i produktów naturalnych (adiuwantów) wobec Mycobacterium tuberculosis poprzez zastosowanie połączenia metabolomiki, transkryptomiki i bioinformatyki oraz walidację wybranych kombinacji in vivo w modelu gruźlicy u danio pręgowanego.
W projekcie wykorzystujemy integrację transkryptomiki i metabolomiki. Transkryptomika dostarcza informacji o funkcjonalnych elementach genomu i ujawnia globalne profile ekspresji genów w komórkach bakteryjnych. Opisuje związek między genami, transkryptami jak i fenotypem, co obrazuje stan metaboliczny komórek. Metabolomika odzwierciedla końcowe produkty transkrypcyjnej, translacyjnej i enzymatycznej aktywności komórki, a tym samym ujawnia informacje o stanie metabolicznym bakterii zarówno w warunkach fizjologicznych, jak i stresowych. Połączenie obu strategii pozwoli opisać i zrozumieć funkcjonalne korelacje między genami o zróżnicowanej ekspresji, a zaburzeniami metabolizmu komórkowego w celu zidentyfikowania szlaków metabolicznych, na które wpływ ma działanie związków przeciwdrobnoustrojowych. Kolejnym krokiem jest walidacja aktywności in vivo w modelu gruźlicy u danio pręgowanego.
Wymagania:
- Absolwent kierunku farmacja, chemia, biotechnologia, biochemia, biomedycyna, inżynieria biomedyczna, analityka medyczna lub kierunków pokrewnych;
- Status doktoranta w momencie rozpoczęcia udziału w projekcie i w okresie realizacji zadań w projekcie/ gotowość do podjęcia kształcenia w Szkole Doktorskiej
- Znajomość zagadnień z zakresu chemii produktów pochodzenia naturalnego oraz chromatografii i spektrometrii mas;
- Znajomość języka angielskiego, zwłaszcza słownictwa fachowego, umożliwiająca swobodne korzystanie z literatury naukowej;
- Znajomość technik laboratoryjnych i umiejętność używania podstawowych sprzętów analitycznych;
- Gotowość do podnoszenia kwalifikacji oraz nauki nowych metod i technik laboratoryjnych;
- Umiejętność pracy w zespole.
Dodatkowymi atutami będą:
- Doświadczenie w analizie próbek techniką LC-MS;
- Doświadczenie laboratoryjne w przygotowaniu próbek do analizy (ekstrakcja, oczyszczania, rozdzielanie);
- Znajomość oprogramowania do analizy danych: Mass Hunter, Mass Profinder, Mass Profiler Profesional; MS-LAMP, MS-DIAL;
- Znajomość baz danych: Metlin, PubChen, Bio-Cyc, NIST, HMDB;
- Znajomość narzędzi bioinformatycznych: XC-MS online, Metaboanalyst;
- Znajomość zagadnień analizy statystycznej i pracy z programami statystycznymi: SIMCA P;
- Znajomość podstawowych programów graficznych oraz oprogramowania do zarządzania cytowaniami.
Opis zadań:
Praca badawcza w zakresie opisanym w projekcie, polegająca na:
- Ekstrakcji metabolitów bakteryjnych i przygotowaniu próbek do analizy;
- Przeprowadzeniu analizy LC-MS, TLC;
- Przetwarzaniu danych uzyskanych z analizy LC-MS za pomocą oprogramowania bioinformatycznego i statystycznego;
- Wizualizacji otrzymanych danych w postaci wykresów i schematów;
- Prezentacji rezultatów badań na zebraniach naukowych zespołu;
- Czynne uczestnictwo w prezentacji wyników projektu;
- Systematyczna oraz zorganizowana praca w zespole badawczym w ścisłej współpracy z kierownikiem projektu oraz innymi pracownikami zatrudnionymi przy realizacji grantu.
Kandydatowi oferujemy:
- pracę w dynamicznie rozwijającym się zespole badawczym,
- możliwość rozwoju naukowego,
- stypendium w wysokości: 5000 zł (brutto brutto) miesięcznie planowane do wypłaty przez okres 24 miesięcy z możliwością przedłużenia do 36 miesięcy.
Wymagane dokumenty
- List motywacyjny zawierający uzasadnienie, dlaczego aplikant ubiega się o oferowane stanowisko, opis realizowanych projektów badawczych oraz nabyte uprzednio doświadczenie i kwalifikacje zawodowe;
- CV;
- Kopie dyplomów oraz pełna lista stopni/tytułów naukowych oraz certyfikatów potwierdzających kwalifikacje zawodowe;
- Lista streszczeń zjazdowych oraz/lub publikacji;
- Klauzula informacyjna.
Dokumenty należy przysłać w formie jednego pliku pdf w terminie do dn. 12 lutego 2024, godz. 18:00 na adres: elwira.sieniawska@umlub.pl
Planowany termin rozstrzygnięcia konkursu: do 15 lutego 2024
Przewidziana data rozpoczęcia prac w projekcie: marzec 2024
Zapytania dotyczące konkursu proszę kierować na adres: elwira.sieniawska@umlub.pl
Dodatkowe informacje:
Wybrani kandydaci otrzymają zaproszenie na rozmowę kwalifikacyjną.
Dopuszcza się sytuację, w której stypendium zostanie przyznane osobie będącej na drugiej pozycji na liście rankingowej, pod warunkiem, że laureat konkursu przed podpisaniem umowy stypendialnej zrezygnuje z jego pobierania.
Dopuszcza się możliwość nierozstrzygnięcia konkursu.
Od decyzji Komisji Stypendialnej nie przysługuje odwołanie.
Stypendium przyznawane jest zgodnie z Regulaminem przyznawania stypendiów naukowych NCN w projektach badawczych finansowanych ze środków Narodowego Centrum Nauki (Załącznik do uchwały Rady NCN nr 25/2019 z dnia 14 marca 2019 r.).
Stypendium naukowe NCN można łączyć z innymi stypendiami oraz wynagrodzeniami finansowanymi ze środków NCN przyznanymi w ramach więcej niż jednego projektu badawczego z tym, że łączna kwota pobieranych stypendiów i wynagrodzeń nie może przekroczyć 5000 zł miesięcznie.